环境科学与工程实验中心（环境保护工程研究所实验室）成立于20世纪80年代，1998年土木工程学院设立环境工程系后，设立环境工程实验室；2001年成立环境科学与工程学院，设立环境科学与工程学院环境工程实验中心，2002年被批准为环境污染与工程环境控制四川省高校重点实验室；2010年11月，该学院与测绘学科、地质学科整合，组建地球科学与环境工程学院，与测绘科学与技术实验中心、地质资源与地质工程实验中心、消防工程实验中心合并成立高速铁路地球科学与环境工程实验教学中心，并于2022年获批四川省省级实验教学示范中心；2023年因学科调整，环境科学与工程学院成立，2024年获批轨道交通智慧环保与可持续发展国际科技合作基地、轨道交通工程污染防治四川省工程研究中心。